Analyses de séquences, utilisation des outils bio-informatiques

Comprendre l’outil informatique dans le domaine de la biologie
moléculaire, spécifiquement pour l’utilisation des bases de
données et l’identification de caractéristiques biologiques simples
– Acquérir les compétences nécessaires à l’analyse bioinformatique
de séquences
– Identifier les principales bases de données et outils
d’interrogation en ligne
– Se familiariser avec les principaux outils d’analyses et
d’alignements de séquences
– Comparaisons de séquences, phylogénie

ENSEIGNEMENTS
Les bases de la bio-informatique
Interrogation de banques de données ; moteurs de recherche
TRAVAUX DIRIGÉS
Stratégies pour l’analyse des séquences
– Nettoyage et interrogation de bases de données à partir
de séquence SANGER
– Manipulation de données de séquençage NGS à partir
de la plateforme GALAXY
PARTIE PRATIQUE – TP
Stratégies et méthodologie
– Choix des outils informatiques
– Comparaison et alignement de séquences (alignements multiples)
– Assemblage, identification de structures génétiques
– Génétique : recherche de motifs et de parties codantes